ITK安装方法

ITK安装方法

答案或建议：

ITK（InsightToolkit）入门与安装
作者：希望(Rinqar) Helenawy
1、引言
ITK 是美国国家卫生院下属的国立医学图书馆投入巨资支持三家科研机构开发医学影像分割与配准算法的研发平台，现已开发了初步版本。是医学影像算法平台的重要组成部分。
对于ITK 国内的应用并不多，但在外国有着非常广泛的应用，虽然ITK 用于医学影像的分割和配准但实际上对于医学图像的预处理有着根本决定的作用，而且ITK是美国国家官方的作品因此其有着良好的发展前景。关于背景和一些相关的知识相信
各位读者比在下懂得多，我也仅仅是为各位高手和一些想学习的相关知识的人做了一下最为简单的引导。在这篇文章中一定会有很多的遗漏和错误，呵呵因为我的英文并不好，看的英文文献很吃力所以有错误的地方希望大家能提出来，而且安装的过程中有很多我也认为不太懂的地方，我会在相关的位置标出，大家如果知道希望能给我一些提点，让我知道哈哈。最后谢谢大家的支持。学习的过程中重在交流，我们的进步也可以通过交流来促进加快。希望大家能在论坛中多提出一些相关的讨论话题。大家一起讨论共同进步。
2、ITK 的应用简介
对于图像分割很多人多部陌生，对于完整的图像为什么要分割？我在这里做一下简单的介绍。下面我们拿医学图像来举例说明。医学CT 图像显示的是断层图像，也就是说当我们拿来一幅医学CT 图像里面有很多部位包括骨骼、软组织等等。比如一
幅头部CT 不仅包括头骨、软组织还有牙齿等等。但在诊断中往往我们只注重一个部位要对它来进行分析判断，就比如说牙齿。所以图像分割可以将牙齿从一幅图像的众多部位中分割出来，这个对于现实中有着重要的意义。图像分割的方法有很多我们还可以应用MATLAB 对图像进行分割提取重点部位。但ITK 究竟较MATLAB 的方法好在哪呢下面我对其进行简单的说明。第一：ITK 提供了很完备的分割应用的算法。第二：ITK 与VTK 相结合可以对分割后的图像进行处理并且进行显示。第三ITK 的库随着时间还在不断的丰富又很好的延伸应用性。因此itk 有着广泛的用途。ITK 功能强大用于图像的分析和处理，但是无法完成可视化，这意味着你需要一些其它的工具来显示你的信息。Vtk 就是一个很好的工具与itk 结合完成可视化。
3、安装ITK
(1)下载
首先从http://www.itk.org/HTML/Download.htm 下载两个文件分别是InsightToolkit-3.2.0 这个是主要ITK 的安装文件与InsightApplications-3.2.0 这个文件主要是用于链接vtk 与itk 之间。
（2）安装步骤：
1 、下载安装cmake,cmake 可以在网站http://www.cmake.org/HTML/Download.html 进行下载安装。这里对cmake 进行一下简单的介绍。itk 跟vtk 相同都是用c++编写的，无论在什么平台，用什么编译器，你都要告诉编译器该如何去编译这么一个庞然大物，在某种程度上itk 经过编译比vtk 还大。工程文件是工程的一般组织形式，比如在vc6.0 下面cmake 的主要作用是生成dsw 类型的工程文件。当然cmake 在不同的编译器下可以生成不同的文件格式，因此也可以生成其他类型的。我的编译器选择的是vc6.0 但是也可以选择vc.net这个根据具体的情况不同适应环境也不同。
2、在硬盘上创建一个空文件夹。文件名为itk.例如如果在e 盘创建该文件夹文件夹名为E:\itk。尽量将vtk 与itk 放在一个盘中方便寻找。将下载下的两个压缩文件夹解压在这个itk 总文件夹中。
3、打开cmake 对itk 进行编译，为了方便起见可以对解压的文件进行重命名。将解压后的文件夹InsightToolkit-3.2.0 重新命名为InsightToolkit 这时对它进行编译。Itk 的安装较vtk 的安装更为方便容易。在itk 这个主文件夹中新建一个文件夹取名bin ， 按照下图图示填写路径地址。BUILD-EXAMPLES\BUILD-SHARED-LIBS\BUILD-TESTING 这三个选项我都选择的off 看了一些英文文献上面对这三个选项说可以选择on 进行编译。但是我试验过都通不过，也可能是我设置的一些问题或者其他的问题。读者请自行进行调试试验。Cmake-install-prefix 这个选项选择编译itk 的总目录，跟vtk 的填写方法相同。点击configure 进行生成相关的工程，当红色选项都变成白色后点击cmake 的ok键。
4、运行vc 打开E:\itk\bin\itk.dsw 这时进行编译。时间根据上面选项选择的ON/OFF 不同编译时间也会不同。如果选择ITK 选项里面的EXAMPLES 和生成动态LIB 文件的选择ON 编译时间则相对较长，生成的库也比较大。这已步很重要编译过程中不能出现错误。完成后可以选择打开E:\itk\bin\INSTALL.dsp 文件。这一步骤不执行也可以。执行这一步主要的目的在于在这一步骤中编译结果就会安装在cmake_install_prefix 设定的目录下。此时ITK 的安装正式完成。将itk 与vtk 进行链接，既然itk 无法完成对分割图像的显示。我们就要把两个东西结合起来一起使用，所以我们应用InsightApplications-3.2.0 来进行链接。
1、 在itk 主文件夹中新建文件夹命名为InsightApplications-bin
2、 运行camke 设置与itk 的设置方法类似Score code 选项填写解压后InsightApplications 的路径，build the binaries 选项添加在新建立文件夹InsightApplications-bin 的路径。这里面有一些选项需要注意。首先是cmake-install-prefix 这个选项选择的路径是InsightApplications 和InsightApplications-bin 所在的路径在这里是咱们的主文件夹itk 的文件路径,这个设置路径与vtk 此选项的设置方法相同。第二个是executable-output-path 路径的设置这里设置的是E:/itk/bin/bin. E:/itk/bin/bin 文件夹是当编译过itk.dsw
后生成的，编译后在itk 这个主目录下依次寻找就可以找到。itk-dir 路径的设置设置的路径为E:/itk/bin 按照要求填写即可。这些选项都是对链接itk 与vtk 之间起到一定作用。
LIBRARY-OUTPUT-PATH 这个选项填写的依然是E:/itk/bin/bin。
最后就是填写vtk-dir 这个路径与itk-dir 填写的路径相同D:/vtk/bin。我的vtk安在了d 盘itk 安在了e 盘。完成了一些设置开始点击configure.这是可能会弹出一个警告告诉你vtk 有一个选项要把off 改成on 这时执行cmake 调整至vtk的设置。点击show advanced 选项找出那个提示的选项点成on 之后configure,ok

再打开cmake 选择InsightApplications 的设置原来设置好会保存下来，主要看cmake 中cmake-install-prefix、executable-output-path、LIBRARY-OUTPUT-PATH、vtk-dir 这几个选项的路径是否跟上面所说的设置保持一致，如不一致调整至上面所说的路径设置。再次configure\ ok 没有提示就表示链接已经成功了。
3、 运行vc 打开 E:\itk\InsightApplications_bin \ itk.dsw 这时进行编译.然后运行E:\itk\InsightApplications_bin\install.dsp 这样InsightApplications 也安装成功了。可以进行itk 与vtk 的混合编程。
最后这种安装方法仅仅是一种参考，itk 的例子由于没有build 没有产生出来。
而且还有很多不明确的地方。写这篇文章只是为了给大家做一个做一个引导，这里也许有很多的错误，希望大家提出来，多多赐教。希望各位高手能对我多提意见，我会进行改正的。能和大家交流学习我深表荣幸。

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